Les Boxer sont prédisposés à certaines cardiopathies congénitales comme la sténose sous-aortique, la sténose pulmonaire et la communication interatriale. Le club de race préconise le dépistage échographique dès l'âge de 1 an. Cet examen consiste en la recherche de toute malformation cardiaque et ne se limite pas aux trois citées auparavant.